Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF397Q8NF99 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms