Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPER1Q8NEC5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CATSPER1Q8NEC5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms