Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms