Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L2Q8NAA4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L2Q8NAA4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG16L2Q8NAA4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L2Q8NAA4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L2Q8NAA4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L2Q8NAA4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L2Q8NAA4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L2Q8NAA4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L2Q8NAA4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L2Q8NAA4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L2Q8NAA4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms