Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC63Q8NA47 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms