Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CSGALNACT2Q8N6G5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CSGALNACT2Q8N6G5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSGALNACT2Q8N6G5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSGALNACT2Q8N6G5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSGALNACT2Q8N6G5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSGALNACT2Q8N6G5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSGALNACT2Q8N6G5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSGALNACT2Q8N6G5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
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