Protein–RNA interactions for Protein: Q8N443

RIBC1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC1Q8N443 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIBC1Q8N443 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIBC1Q8N443 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIBC1Q8N443 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIBC1Q8N443 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIBC1Q8N443 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIBC1Q8N443 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.5 ms