Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00518Q8N0U6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms