Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D3Q8IZS8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms