Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX18

DHX40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX40Q8IX18 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX40Q8IX18 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX40Q8IX18 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX40Q8IX18 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX40Q8IX18 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX40Q8IX18 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms