Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FUNDC1Q8IVP5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FUNDC1Q8IVP5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms