Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA4Q8IV77 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms