Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMPRSS6Q8IU80 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms