Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC4Q7Z404 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMC4Q7Z404 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms