Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APTXQ7Z2E3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APTXQ7Z2E3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms