Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2AQ7L0J3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms