Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms