Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms