Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms