Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL17Q6UXB2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms