Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW63

KDELC1, KDEL motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELC1Q6UW63 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDELC1Q6UW63 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELC1Q6UW63 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms