Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOA5Q6Q788 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms