Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNV1Q6PIU1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms