Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN1Q6NZI2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms