Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
REEP3Q6NUK4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP3Q6NUK4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms