Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPECC1LQ69YQ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms