Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms