Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD16Q68DU8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCTD16Q68DU8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD16Q68DU8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms