Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GKAP1Q5VSY0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms