Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
RSPH4AQ5TD94 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RSPH4AQ5TD94 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RSPH4AQ5TD94 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms