Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEPDC1Q5TB30 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1Q5TB30 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms