Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf220Q5T0J3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms