Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PERM1Q5SV97 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms