Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD3Q5JSP0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms