Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms