Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF394Q53GI3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms