Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP55Q53EZ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP55Q53EZ4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms