Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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