Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNOP1Q1ED39 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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