Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF1Q17RB8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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