Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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