Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHQ16836 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHQ16836 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHQ16836 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHQ16836 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHQ16836 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHQ16836 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHQ16836 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHQ16836 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHQ16836 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHQ16836 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHQ16836 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHQ16836 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHQ16836 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHQ16836 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHQ16836 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHQ16836 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHQ16836 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHQ16836 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHQ16836 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHQ16836 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HADHQ16836 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HADHQ16836 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HADHQ16836 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HADHQ16836 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HADHQ16836 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HADHQ16836 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HADHQ16836 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HADHQ16836 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHQ16836 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHQ16836 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHQ16836 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHQ16836 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHQ16836 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHQ16836 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHQ16836 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHQ16836 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHQ16836 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHQ16836 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHQ16836 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHQ16836 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHQ16836 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHQ16836 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHQ16836 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHQ16836 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHQ16836 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHQ16836 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHQ16836 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHQ16836 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHQ16836 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHQ16836 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHQ16836 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHQ16836 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHQ16836 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHQ16836 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHQ16836 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHQ16836 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHQ16836 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHQ16836 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHQ16836 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHQ16836 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHQ16836 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHQ16836 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHQ16836 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHQ16836 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHQ16836 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHQ16836 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHQ16836 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHQ16836 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHQ16836 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHQ16836 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHQ16836 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHQ16836 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHQ16836 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHQ16836 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHQ16836 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHQ16836 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHQ16836 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHQ16836 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHQ16836 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHQ16836 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHQ16836 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHQ16836 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHQ16836 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHQ16836 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHQ16836 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms