Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
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NFIL3Q16649 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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NFIL3Q16649 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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NFIL3Q16649 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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NFIL3Q16649 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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