Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NTRK3Q16288 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms