Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIP10Q15642 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP10Q15642 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms