Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCLAFQ15004 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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