Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ODF1Q14990 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ODF1Q14990 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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