Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF3Q14653 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF3Q14653 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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