Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPIDRQ14159 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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SPIDRQ14159 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPIDRQ14159 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms