Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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