Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDK13Q14004 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
CDK13Q14004 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
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